São Domingos do Norte foi criado pela lei 4343 de 30 de março de 1990 e instalado em 1 de janeiro de 1993, sendo sua área proveniente do município de Colatina.
O município de São Domingos do Norte surgiu como vila no início do século XX, quando os colonizadores começaram a desbravar o Norte do Estado. Um agrimensor de nome Alberto Mallacarne, conhecido como Bortolo, começou, por volta de 1918/1920, a medir as terras nesta região, enviado pelo Governo do Estado. Bortolo e sua equipe ali chegaram num dia de domingo, razão pela qual batizaram de São Domingos o novo local, que se desmembrou do município de Colatina, através da Lei estadual n.º 4.347, de 30 de março de 1990, sendo instalado em 1º de janeiro de 1993.
O município São Domingos do Norte começou a ser colonizado em 1928, quando a região era conhecida como Sabiá.
Os primeiros ocupantes foram os pioneiros Bortolo Malacarne, Clério Espíndola, Henrique Santana e Moacir Brotas.
A emancipação ocorreu em março de 1990. A agropecuária é a base da economia.

Distrito criado com a denominação de São Domingos, pela lei estadual nº 265, de 22-10-1949, com território desmembrado do distrito de Alto Rio Novo. Subordinado ao município de Colatina.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1950, o distrito São Domingos figura no município de Colatina.
Elevado à categoria de município com a denominação de São Domingos, pela lei estadual nº 777, de 29-12-1953, desmembrado de Colatina. Sede no antigo distrito de São Domingos. Constituído de 5 distritos: São Domingos, São Gabriel, Águia Branca, Vila Verde e Valério. Todos os distritos desmembrados do município de Colatina.
Por decisão do Supremo Tribunal Federal, – Acordão de 04-10-1955, foi anulado o ato de criação do município de São Domingos, em conseqüência do qual voltou o município a condição de distrito de Colatina.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o distrito de São Domingos, permanece no município de Colatina.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 18-VIII-1988.
Elevado à categoria de município com a denominação de São Domingos do Norte, pela lei estadual nº 4347, de 30-03-1990, desmembrado de Colatina, sede no antigo distrito de São Domingos, atual São Domingos do Norte. Constituído do distrito sede. Instalado em 01-01-1993.
Em divisão territorial datada de 1-VI-1995, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2005.